非課税期間20年間が終わると、つみたてNISA内の投資信託は、特定口座や一般口座などの課税口座に移り、その後の分配金や売買益等については課税されます。
なお、つみたてNISAは通常のNISAと異なり、ロールオーバー（非課税期間終了後、翌年の非課税枠を利用してつみたてNISAでの保有を続けること）はできません。